Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgef1cQ9D300 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rasgef1cQ9D300 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgef1cQ9D300 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms