Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tssk3Q9D2E1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms