Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SarnpQ9D1J3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms