Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88Q9D0N8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms