Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmss1Q9CZT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms