Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc77Q9CZH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc77Q9CZH8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms