Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl55Q9CZ83 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl55Q9CZ83 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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