Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms