Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrtapQ9CYD3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms