Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms