Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms