Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yif1bQ9CX30 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yif1bQ9CX30 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms