Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm8aQ9CWZ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms