Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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