Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxxc1Q9CWW7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms