Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd3Q9CWR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms