Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6kQ9CWP4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6kQ9CWP4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms