Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BccipQ9CWI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms