Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms