Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms