Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029F12RikQ9CRB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms