Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exosc5Q9CRA8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exosc5Q9CRA8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms