Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms