Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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