Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1lc3bQ9CQV6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms