Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms