Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kdelr2Q9CQM2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kdelr2Q9CQM2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kdelr2Q9CQM2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms