Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb9Q9CQJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms