Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms