Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms