Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc5Q9CQA1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc5Q9CQA1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms