Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NepnQ9CQ76 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NepnQ9CQ76 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms