Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms