Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
StambpQ9CQ26 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms