Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms