Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg3Q9CPX6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms