Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms