Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Bcl11bQ99PV8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms