Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms