Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scd3Q99PL7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scd3Q99PL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scd3Q99PL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms