Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ1

Pcdh15, Protocadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh15Q99PJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh15Q99PJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh15Q99PJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh15Q99PJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdh15Q99PJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms