Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms