Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NsmfQ99NF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms