Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbx4Q99NE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbx4Q99NE9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbx4Q99NE9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms