Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rims1Q99NE5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms