Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcgf6Q99NA9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms