Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atoh8Q99NA2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Atoh8Q99NA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms