Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brms1Q99N20 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms