Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac9Q99N13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdac9Q99N13 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms