Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel1Q99MW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramel1Q99MW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramel1Q99MW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms